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猪USF1基因克隆与序列分析
摘要：研究克隆了猪USF1基因1 382 bp的cDNA序列(登录号：EF 219407)和5 516 bp的DNA序列(登录号：EF 625885)。序列分析发现猪USF1基因编码区序列与人、小鼠的同源性分别为99%和98%。基因组序列分析发现猪USF1基因包含11个外显子和10个内含子，内含子的剪接方式均符合“GT-AG”法则。
关键词：猪;USF1基因;克隆;序列分析
中图分类号：S828;Q78 文献标识码：A 文章编号：0439-8114(2013)24-6175-03
上游刺激因子1(Upstream stimulatory factor 1，USF1)是螺旋-环-螺旋亮氨酸拉链(HLH- LZIP)转录因子家族成员之一[1]，可以与USF2形成二聚体，并能识别DNA的E-box序列，调节基因转录[2]。人类USF1基因位于1q22-q23[3]，并广泛表达于机体的各个组织，调控糖和脂肪代谢基因的表达[4]，此外USF1基因还具有调节免疫反应和细胞周期的功能[5]。研究发现USF1基因可以作为调节治疗人的胰岛素抵抗葡萄糖不耐症、II型糖尿病和向心型肥胖易感症的候选基因[6-9]。本研究利用EST信息和测序的方法克隆了猪USF1基因并进行了序列分析，为进一步研究该基因对猪生长发育的调控机理具有重要的意义。
1 材料与方法
1.1 试验材料
采集4月龄大白猪(湖北省农业科学院畜牧兽医研究所原种猪场)的肌肉组织，用液氮速冻置于
-70 ℃中，利用TRizol法提取总RNA，反转录得到cDNA。利用DNA提取试剂盒[天根生化科技(北京)有限公司]提取DNA，贮存于-20 ℃。