百合文库
首页 > 网文

不会做基因敲除细胞株?轻松5步构建流程(2)

2023-06-27 来源:百合文库
4具体原因:只能是肿瘤细胞系,不能是永生细胞系,往往很多永生细胞系做起来都比较有挑战性,当在做基因敲除细胞株时,如果敲除效率是x,则拷贝数是n,那么纯合敲除的效率就是:x^n,可见效果就不显著了。
二. 基因敲除细胞系的敲除方法:
1.建议首选:如果只是做常规的移码敲除,那么一个细胞里面只有2个基因位点,是很难保证两个基因位点是一样的移码,所以得到移码的数据也不同,当你在鉴定测序看图的时候就没有那么清晰,所以,选择片段敲除是一个较为有效的办法。
2.关键点:移码敲除在很多时候并不彻底,会在后续的实验中出现Western Blot的问题,出现神秘的条带,大片段的基因敲除是几kb的缺失,mRNA就没有目的蛋白的转录,Western Blot问题也解决了,鉴定敲除方法:纯合敲除细胞系,比移码敲除效率更高。

不会做基因敲除细胞株?轻松5步构建流程


3.如何判断是大片段敲除的细胞系:主要是通过目的基因片段对PCR扩增的方式判断。
三. 细胞周期分析:
1.如果采用病毒法,构建载体,病毒包装,转染细胞,细胞筛选,单克隆,PCR鉴定/测序,扩增——一个步骤都不能少。
2.使用转座子系统,构建好敲除质粒后,直接用质粒电转到细胞。
3.做基因敲除细胞株时,不要选择增殖太慢的,如果过表达量的Cas9蛋白 gRNA快速靶向,最快只需要5周时间,7-12周就可以得到纯合子细胞。
四.细胞拿到怎样用:
如果是单克隆的细胞需要大量扩增,完全不用担心培养过程中蛋白恢复的问题,所有的细胞都必须经过严格测试,保证安全无污染,低内毒素可以直接用于动物体内实验,做代谢分析也能更加安心。如果移码突变,大量扩增可能会出现恢复(特别是敲除的蛋白对细胞增殖有优势的情况)细胞动物实验和代谢研究更放心。 

不会做基因敲除细胞株?轻松5步构建流程


猜你喜欢