序章

灰原哀篇
在慌张逃离黑色组织的掌控后，宫野志保，哦不，变小后的宫野志保倒在了工藤新一家门口，被住在隔壁的阿笠博士带回自己家，从此化名灰原哀。
遇到了江户川柯南后，明白了他就是变小后的工藤新一，灰原哀一开始谨慎、恐惧、对一切拥有戒备心，但经历大学教授杀人事件对柯南展露了她那脆弱的一面；面对组织的压迫和以往经历的自责，在经历生死一瞬间（公交车爆炸）事件后，愿意开始听从柯南的建议，不再逃避自己的命运，而后跟随少年侦探团处理一件件案件，也开始对步美、元太和光彦产生了友谊，也习惯了作为灰原哀的日常，心底慢慢对在她黑暗的世界中带来一丝光亮的少年产生了依赖。
面对对柯南的感情，她只敢偷偷的藏在心里，有时候过分暴露了自己的感情也以开玩笑的方式进行掩饰，因为那位大侦探还有他的天使需要守护，那位天使如此的善良和美丽，像她的姐姐一样，像海豚一样，大家都喜欢海豚，而自己就像是从至暗的深渊中逃出来的不讨人喜欢的鲨鱼，怎么会有人选择鲨鱼而不选择海豚呢？灰原哀明白现在自己唯一的任务就是在黑暗组织杀了她之前将柯南带回到那位天使的身边，即使前方是刀山火海，她也不愿自己带来的黑暗笼罩工藤新一和毛利兰。
但如果只是幻想，她也曾想：”如果是我，可以的话，倒宁可失去记忆，忘记一切，做个单纯的小学生灰原哀不知该有多好，然后，就能跟你永远…永远这样”
柯南篇
在跟踪黑衣组织被发现，被迫服下毒药，但身体意外变回10年前小孩时的身体，为避免被黑衣组织发现自己还没有死去而祸及家人，以江户川柯南的身份暂住在毛利家。