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发卡(Stem-loop)(19)

“我最近就正好在处理这方面的数据,分析一些肠道微生物宏基因组的序列。原本是想看看和不同疾病之间发生的相关性,但却发现了一些诡异的事情。虽然微生物的多样性有不小的差异,但不论是来自南半球的样本,还是我们本国的样本,都无一例外地出现了一个很罕见的结构——原本双链的 DNA 基因组,其中一条链多出了一小段。因为两条 DNA 链的其他部分还是正常配对,所以这一小段就会凸出来。不仅如此,这凸出来的一小段首尾也能够相互配对,就像叠起来了一样,展现出来的二级结构就类似一个长长的发卡。”魏吉继续低声说道。

发卡(Stem-loop)


可能是听得太过专注,也可能是听得有点懵,侯米眼睛盯着魏吉,但嘴唇一直吮吸着杯中所剩不多的咖啡,不时发出吸到冰块时特有的声响。
“事实上,类似的发卡结构在生物体里面十分常见,但这个发卡也太长了,长到有点不真实,并且序列高度稳定,所以我猜测这个多出来的发卡序列,可能是某种病毒在这些肠道微生物基因组里留下的痕迹。”魏吉也喝了口咖啡,然后说道:“这个折叠的转角处,会有一些没法和其他序列配对的碱基,它们在转角处会形成一个小环,最神奇也最诡异的事情就发生在这个小环上。其他同行手里的数据无一例外都显示,这个小环的序列是‘TTTTTTTTT’,但我手里的每一份测序结果都不是这个,而是‘CAC ATA ATG AGA TGG GAA ATT’。”

发卡(Stem-loop)


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