《竞赛党的逆袭》1.1(5)

学姐晃动鼠标，电脑屏幕亮了起来，上面显示出一个蛋白质的结构，蛋白质周围是大量水分子，这让石历宇想起了市队选拔赛的第一道编程题。
“我现在展示的是蛋白质分子模拟，这是CADD的重要一环，不爽不要玩。”学姐轻佻地捋了捋头发，按下键盘上的回车键，分子模拟动画开始播放，水分子以肉眼看不清轨迹的速度剧烈地运动，同时蛋白质的结构也开始变化，不过速度要慢上很多。
“哦sorry，刚刚角度有点不对，”动画重复播放几遍后，学姐才发现了什么，她用鼠标把蛋白质转了半圈。
在蛋白质的另一侧，有个小分子嵌在上面——它的结构比一氧化二氢复杂得多，不过相较于巨大的蛋白质，就像枣糕上的一颗枣。
但这颗枣是特别的，它与蛋白质的接触的部分被鲜艳的颜色标记。这些颜色不断地变化，展示着分子相互作用。
“我现在演示的是小分子药物与受体蛋白的分子对接，这是虚拟筛选的步骤之一。软件通过智能算法评估对接效果，把分数高的药物留下来，分数低的淘汰掉。”
学姐这句话暗示得太明显了，让石历宇感到相当不舒服。
“我们经常同时对几十个分子进行计算，软件会识别这些分子之间的结构差异，根据原始结果自动调整反应条件，以达到很高的精确度。”学姐说。
“几十个？这么多？”杨灵聪张大了嘴。
“这只是药物分子库中的一小部分精英选手哦。”学姐轻笑，“你猜我们的分子库总共有多大？”
“呃……好几百个？”
“好几百万个才差不多。”学姐露出关爱的眼神，“我是说，针对一个靶点，或者说一个目标疗效，我们就有好几百万个备选小分子。如果是大分子药物，这个数字是几万亿。但是，最终成为新药，进入医院治病救人的，可能只有一两个分子而已。”
在这个天文数字中亿里挑一，恐怖如斯的浩大工程真不是人类能够想象出来的。
学姐指了指屏幕，继续说：“为了模拟100纳秒的动画，我调用渤海一号的一个GPU节点计算了一天的时间。如果我们对几百万个分子都进行暴力模拟对接，就算占用渤海一号的全部节点，这辈子也算不完。”
石历宇对渤海一号只有十分模糊的印象，好像是中科院和济广大学合作研发的超级计算机。
“不过之前，在渤海一号的帮助下，人工智能已经把绝大部分不合适的分子过滤掉了。在这项技术没出现的时候，进入模拟过程的分子数量是现在的十多倍呢。”
“这么碉堡的人工智能软件是谁做的？”杨灵聪一拍大腿。
“是我们大学和齐联合作的，不过它只是整个CADD项目的一环，“学姐伸手指了指东北方向的空气：“在临港新区，齐海联合工程公司总部，CADD项目组占据了正门前双子大楼的整个右翼。使用这个系统的不仅有齐联的十几个制药子公司，还有全球各地很多药企，可以说是为联合公司贡献了相当的利润。“
学姐这番话并没有让石历宇很震惊，各种宣传资料他是看得不能再多。对于一个横跨多领域的超级企业来说，新药研发这种为万世开太平的工作肯定是要大力宣传的。不仅是为了满足本地吃瓜群众的自豪感，也要向上面表示自己是良民，不会去不该去的地方搞事。