书中主要讲了一位名叫汤米·斯达宾斯的小男孩,他渴望当一名水手。一天,他找“博物学家”约翰·杜利特医生为受伤的松鼠治疗。杜利特医生可以和动物说话,他的家中有许许多多的动物。斯达宾斯很喜欢杜利特,斯达宾斯征求家人和医生的同意后,要跟着杜利特生活、学习两年。不久,杜利特带着斯达宾斯和邦波经历了重重危险,一起开着船,来到了蜘蛛猴岛。他们在那里救出了被困在山洞里的长箭以及九个印第安人,并用他的智慧巧妙地化解了两个民族之间的矛盾,使他们和平共处。因为这些,他被选为那里的国王。但他想回到泥塘镇,继续研究动物和它们的语言。最终,经历了思想斗争的他,悄悄地,依依不舍地离开了蜘蛛猴岛。